Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Traf3ip1Q149C2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms