Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rundc1Q0VDN7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms