Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps8Q0P5W1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms