Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc4Q08624 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc4Q08624 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc4Q08624 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc4Q08624 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc4Q08624 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc4Q08624 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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