Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CbfbQ08024 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms