Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
F13bQ07968 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms