Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm12171-201ENSMUST00000150895 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox12Q04890 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms