Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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