Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mc1rQ01727 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms