Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms