Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms