Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H3f3aP84244 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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