Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cbx1P83917 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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