Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gbx1P82976 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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