Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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SgcgP82348 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcgP82348 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SgcgP82348 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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