Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
TgfbiP82198 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TgfbiP82198 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TgfbiP82198 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TgfbiP82198 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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TgfbiP82198 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TgfbiP82198 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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TgfbiP82198 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms