Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Otx2P80206 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Otx2P80206 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Otx2P80206 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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