Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Polr1bP70700 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms