Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NficP70255 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NficP70255 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms