Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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