Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CgnP59242 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CgnP59242 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CgnP59242 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CgnP59242 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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