Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cldn18P56857 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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