Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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