Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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LtbrP50284 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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LtbrP50284 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LtbrP50284 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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