Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PpargP37238 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PpargP37238 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PpargP37238 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PpargP37238 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PpargP37238 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PpargP37238 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PpargP37238 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PpargP37238 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PpargP37238 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms