Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Usp4P35123 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp4P35123 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp4P35123 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp4P35123 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp4P35123 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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