Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Apoc3P33622 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Slc18a2-201ENSMUST00000026084 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Apoc3P33622 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms