Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cd28P31041 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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