Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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