Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Hoxd8P23463 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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