Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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PrkchP23298 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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PrkchP23298 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PrkchP23298 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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