Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Eif3aP23116 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms