Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pou3f1P21952 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms