Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prim1P20664 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms