Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Irf1P15314 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Irf1P15314 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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