Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P10404 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
P10404 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
P10404 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms