Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PomcP01193 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PomcP01193 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PomcP01193 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PomcP01193 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PomcP01193 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PomcP01193 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PomcP01193 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PomcP01193 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms