Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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DffaO54786 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
DffaO54786 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
DffaO54786 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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