Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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