Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm42765-202ENSMUST00000200017 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Smok4a-202ENSMUST00000144015 2317 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gpr171-201ENSMUST00000085040 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Gm21887J3QQ04 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Gm21887J3QQ04 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Gm21887J3QQ04 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Gm21887J3QQ04 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 H2-M1-201ENSMUST00000041662 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gm21887J3QQ04 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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