Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm2056J3QQ02 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm2056J3QQ02 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms