Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm2035J3QP87 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms