Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vmn1r34G3XA52 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vmn1r34G3XA52 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vmn1r34G3XA52 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vmn1r34G3XA52 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vmn1r34G3XA52 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Vmn1r34G3XA52 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r34G3XA52 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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