Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
H2-M1F7CXU4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms