Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc8E9PWG2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc8E9PWG2 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms