Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms