Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnf217D3YYI7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf217D3YYI7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms