Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Cfap126-204ENSMUST00000129651 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lce6aD3YV94 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms