Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phf11cB4XVP9 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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