Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rd3lB2RV38 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms